如何进行GEO临床数据查询

发布于 2021-04-09 01:47

推荐两个可以进行GEO临床数据下载的网址

乔治敦癌症数据库（G-DOC）（https://gdoc.georgetown.edu/gdoc/），G-DOC是一个精准医学平台，其中包含来自一万多个患者和细胞系的分子和临床数据，以及用于分析和数据可视化的工具。该平台可对多种数据类型进行综合分析，以了解疾病机理。

Tips:目前该网站不能进行非乔治大学的注册，所以，大家可以去某宝自行寻觅账号~

LOGpc数据库（http://bioinfo.henu.edu.cn/DatabaseList.jsp ）同样整理归纳了TCGA和GEO的数据，不能下载，可以选择对应的GEO数据集对单基因进行生存分析，包括多种分析方式OS,DFI,DSS,PFI，以及TNM分期，是否有合并症等信息。自己可以根据网站显示的GEO序列号在GEO数据库里搜寻，自行下载对应的临床资料。