嘉因生物公众号目录更新

发布于 2021-09-08 10:08



01
普通转录调控方向



01

ChIP-seq专题

  1. 嘉因生物super enhancer 专题二

  2. 嘉因生物super enhancer 专题一

  3. 超级增强子专题三——为您准备百篇文献！

  4. 我为啥不查有没有ChIP级别抗体

  5. 诺奖速递：细胞氧应激的核心转录因子HIF ——聊聊2019年诺奖得主William G. Kaelin参与发表的一篇论文~

  6. 转录因子和靶基因系列（一）转录因子调控哪些下游基因，有实验证据的线索

  7. 转录因子和靶基因系列（二）按类检索转录因子ChIP-seq数据

  8. 转录因子和靶基因系列（三）哪个TF会来结合我这段DNA

  9. 药物处理多久后能看到组蛋白修饰的变化？

  10. ChIP实验，这家公司做的怎么样？有图有真相

  11. ChIP-seq不画出这样的结果图，哪好意思说自己是做生信的

  12. 谁来调控我感兴趣的DNA？100%可行的全面解决方案V2.0

  13. 转录因子调控了谁？100%可行的完整解决方案V2.0

  14. 哪个蛋白质调控我感兴趣的基因？怎样筛选？基于分析或实验的可行方案V2.1

  15. 搜抗体，哪家强？| 人工智能帮你找抗体，BenchSci，实时显示引文Figure

  16. 做过ChIP-seq或ATAC-seq的物种速查

  17. 转录因子调控了谁？挖全天下所有高通量实验数据，只为您解决这一个问题

  18. 点鼠标就能找启动子区的motif | meme-FIMO

  19. 互补链上的motif有意义吗？

  20. 找到了motif，怎样展示结果？

  21. 他中了国自然，因为最后一周补了这张图

  22. Plan A详细步骤1234 | 哪个转录因子调控我的基因？

  23. 国自然爱明星，拉你的基因进明星通路，一图搞定

  24. 哪个转录因子调控你的基因？Plan C，不需要那么多ChIP-seq

  25. “突变”影响了“转录因子”结合，这个图你一定需要

  26. 100幅发表级的美图！眼瞅着别人都拿去发paper了

  27. 有必要测那么多吗？转录组、ChIP-seq、ATAC-seq、DNA甲基化、RNA甲基化神马的都测一遍？

  28. ChIP-seq客户文章分享|嘉因生物坚守表观5春秋

  29. cell最受欢迎的癌症文献解读-染色质状态的转变与发育和环境相关

  30. 哪个转录调控子调控了我的基因集，Lisa新年放大招

  31. 超级增强子研究3部曲

  32. 神技能，让你手里的ChIP-seq和RNA-seq数据1+1>2

  33. ChIP-seq一小步，心肌肥厚lncRNA一大步

  34. 植物转录因子调控网络该怎么研究？

  35. 实验不用多，有这两个就够了

  36. 癌症化疗耐药怎么破？从TET1找找着手点

  37. ChIP-seq+RNA-seq如何搞定PNAS?


02

CUT&Tag专题

  1. 嘉因生物的冰冻组织CUT&Tag来了！质量如何？用数据说话

  2. 官宣！嘉因生物CUT&Tag服务上线

  3. 数据告诉你，CUT&Tag的优势在哪里？

  4. 转录因子怎么选ChIP-seq or CUT＆Tag？我们的推荐是有依据的

  5. ChIP-seq和CUT&Tag放在一篇文章中，不冲突~

  6. 国内首篇! 一区IF 13.584 I 嘉因生物CUT&Tag助力大刺鳅性染色体起源的研究


03

ATAC-seq专题

  1. 从第一篇文章开始，讲讲ATAC-seq能干啥？

  2. 关于 ATAC-seq，你需要知道的 7 件事

  3. 哪个蛋白质调控我感兴趣的基因？怎样筛选？基于分析或实验的可行方案V2.1

  4. 找转录因子靶基因，没有ChIP抗体？ATAC-seq也能实现 | ATAC-seq实验服务

  5. 做过ChIP-seq或ATAC-seq的物种速查

  6. 新！加这个实验给你的paper加5分 | 植物ATAC-seq文章和数据都在这里

  7. 大牛新宠，转录调控研究神器！找关键转录因子、推测转录因子-靶基因关系

  8. 老板让找DNA转录调控分子，这个技术十拿九稳

  9. 转录因子调控了谁？挖全天下所有高通量实验数据，只为您解决这一个问题

  10. ATAC-seq能干啥？看这一篇就够了 | 合成致死的ARID两兄弟是怎么分工的？

  11. 【答疑】ATAC-seq的重复次数

  12. 水生生物的ATAC-seq数据和文章都在这里

  13. 单细胞ATAC-seq | 果蝇ATAC-seq数据和文章都在这里

  14. 快做ATAC-Seq实验吧！生信人都等着挖掘数据呢！

  15. 哪个转录因子调控你的基因？Plan C，不需要那么多ChIP-seq

  16. 任意两组RNA-seq变身，国自然得AAA

  17. 什么样的ATAC-seq是成功的？第一期：ENCODE的ATAC-seq质量把关标准

  18. 研究enhancer需要Hi-C？NO！只要ATAC-seq加这步分析，搞定！

  19. 猛然发现，我们已经攒齐了这篇Nature所有的Figure

  20. 这篇刷爆朋友圈的Nature文章，居然用到了这么多表观技术？

  21. 嘉因生物ATAC-seq & RNA-seq助力阿尔兹海默症发病机制的研究

  22. 注意！男性寿命短于女性？原来还有表观方面的原因

  23. 7个因子重编程的故事

  24. Plos Pathogen嘉因一作|ATAC-seq揭示病毒侵染影响宿主染色质可及性变化

  25. 揭秘，神经细胞如何做ATAC-Seq

  26. ATAC-seq差异分析方法怎么选？

  27. 就ATAC-seq而言，看看SRA vs GEO收录的物种差别有多大

  28. 断尾求生也是一种生存技能

  29. 这篇IF13.493的文章总结起来居然只有4步

  30. 一区IF 9.727│嘉因生物ATAC-seq助力靶向p300/CBP作为肝癌治疗策略研究

  31. 一区IF 11.864|嘉因生物ATAC-seq助力唐氏综合症研究

  32. 一区12分 | 嘉因生物ATAC-seq助力阐明PTEN-BRG1协同致死机制

  33. 二区4.2分|食用菌首个ATAC-seq由嘉因生物完成

  34. 嘉因生物ATAC-seq助力国内首篇高粱表观遗传研究

  35. 二区8.143|组织ATAC-seq助力食管鳞状细胞癌研究


04

eccDNA（环状DNA）测序专题

  1. 科研新宠儿-eccDNA

  2. 你知道吗？很多eccDNA研究都是参考这篇文章

  3. 什么？ATAC-seq数据居然能鉴定eccDNA？

  4. 这是一份详细的eccDNA富集protocol

  5. 时隔多年，eccDNA在酵母衰老研究中光芒重现

  6. 千呼万唤始出来的eccDNA测试数据，果然没让人失望

  7. 5位专家全方位解析eccDNA

  8. eccDNA常见分析问题解答，你值得拥有

  9. 千呼万唤始出来的eccDNA测试数据，果然没让人失望

  10. 血液样本如何开展eccDNA研究？

  11. EcDNA和表观再次神结合，发现ecDNA在癌细胞内“团伙作案”

  12. 原来有这么多染色体外环状DNA

  13. EccDNA 的验证，你清楚吗？

  14. 癌症中ecDNA到底多重要？

  15. 再一篇！植物中染色体外环状DNA新成果

  16. eccDNA 研究路线：滚环扩增法和Tn5酶切法对比

  17. 嘉因生物cfDNA eccDNA Tn5酶切法，值得信赖

  18. 数风流研究，还看染色体外环状DNA



05

MeRIP-seq专题

  1. 嘉因生物 MeRIP-seq强化升级啦，最低只需1 μg total RNA

  2. 火了！m6A----国自然告诉你m6A到底有多火

  3. 揭秘|如何用少量样本做m6A研究

  4. 冲击国自然，就靠这个实验了，刚好来得及

  5. 表观遗传领域新方向——m6A-seq&组蛋白修饰

  6. 文献速递：m6A去甲基化酶抑制胰腺癌肿瘤发生机制的新发现

  7. m6A的直播链接，我迫不及待想分享给您

  8. 1 ug RNA做不了MeRIP-seq？嘉因生物有绝招

  9. m6A的直播，我迫不及待想分享给您

  10. M6A-让病毒成为伪装者

  11. REPIC数据库：可以将m6A数据与表观数据联合分析

  12. 二区7.032|嘉因生物MeRIP-seq助力糖尿病性白内障研究

  13. METTL3在癌症中扮演怎样的角色？略知一二三

  14. 三篇15+分文章，通过MeRIP-seq对结直肠癌做了点啥

  15. 一区！IF 14.971︱嘉因生物MeRIP-seq助力RFA导致肝癌细胞转移机制研究

  16. 二区7.032|嘉因生物MeRIP-seq助力口腔鳞状细胞癌研究

  17. m6A都有哪些相关验证实验？来看一下吧



06
各种转录组测序专题

  1. 二区5.5分|嘉因生物RNA-seq助力麻醉剂吸入影响大脑发育损伤机制研究

  2. RT-qPCR验证，选哪个lncRNA的哪段设计引物？我要百发百中！

  3. miRNA的RT-qPCR验证，小伙伴儿亲测，高效，便宜，不限物种（附各试剂货号）

  4. miRNA家族成员列表下载 | 人/小鼠/果蝇/线虫 | 还提供命令行

  5. 谁来调控我感兴趣的lncRNA/circRNA/miRNA | 100%可行的解决方案V2.0

  6. Ensembl基因组+注释 | 物种速查 | 植物

  7. Ensembl基因组+注释 | 物种速查 | 动物

  8. 同样用Ensembl算TPM，结果还是不一样？ | Ensembl的注意事项

  9. 选哪个lncRNA的哪段设计引物？RT-qPCR验证，我要百发百中！

  10. 把RBP跟表型、疾病联系起来 | 研究转录后调控，用清华鲁志的POSTAR

  11. 用RNA-seq也能找到开放染色质，ATAC-seq不开森

  12. 全世界的miRNA分析工具都在这里 | 平行对比多个工具的靶基因预测结果

  13. 史上最全ncRNA数据库：RNAcentral | 最权威的EMBL-EBI出品

  14. 转录因子调控了谁？挖全天下所有高通量实验数据，只为您解决这一个问题

  15. miRBase物种名缩写速查表 | 分享解决问题的过程，包治百病

  16. RNA-seq这样画图，国自然必得A

  17. 任意两组RNA-seq变身，国自然得AAA

  18. 你的miRNA-seq数据要重新分析吗？

  19. 我研究的miRNA没，没，没了

  20. RNA-seq居然能挖出这么多机制！给你的文章加5分

  21. 大部分做lncRNA的都以为自己在研究lncRNA，其实你研究的是......

  22. 9年前Nature筛出来的那些lncRNA，后来怎么样了？

  23. 结论相反？2016 Nature 和 2018 Cell Stem Cell，linc1405到底是不是作为RNA在起调控作用？

  24. 把RNA跟基因型、疾病联系起来




02
单细胞转录调控方向



01
单细胞ATAC-seq&单细胞RNA-seq技术专题

  1. 为马老师解惑10x单细胞ATAC技术

  2. 一篇文章学会单细胞ATAC-seq

  3. 文献速递：单细胞测序证明眼前间质的异质性，以发掘新的眼前节发育/功能标记基因

  4. 最新上线，有手就能学会的scRNA&scATAC分析工具

  5. 当scATAC-seq遇到scRNA-seq，结果怎么样了？

  6. 看scRNA-Seq+scATAC-Seq联手，拿下《Blood》高分文章

  7. 为何老人更易感染COVID-19？单细胞告诉你答案

  8. 从数据分析到结论产生，谈谈scATAC-seq

  9. 首个这种类型的单细胞数据库，你值得拥有

  10. 注意！单细胞RNA数据存在细胞周期效应，嘉因教您如何处理

  11. 单细胞知识点-单细胞通讯分析新利器 CellChat

  12. 假如有一天，我能再生一颗心脏

  13. 单细胞知识点-测序深度和细胞量对细胞分群的影响

  14. 想做scATAC-Seq？至少先看懂这个

  15. 单细胞知识点——细胞注释工具SingleR 之原理篇

  16. 植物10XGenomics单细胞转录组测序阶段性整理V1

  17. 单细胞知识点——细胞注释工具SingleR之操作篇

  18. 单细胞RNA-seq数据如何进行自动注释？关于singleR和参考集的那些事

  19. 组织解离有话说-解离方法

  20. 组织解离有话说-解离日报（小鼠肺）

  21. 组织解离有话说-解离日报（小鼠视网膜）

  22. 组织解离有话说-解离日报（小鼠耳朵）

  23. 组织解离有话说-解离日报（人肺癌）

  24. 组织解离有话说-解离日报（人肠道）

  25. 嘉因生物高效助力单细胞实验之上门篇

  26. 单细胞注释神器之Cell Blast

  27. 基于10XGenomics的病毒侵染单细胞实验



02

空间转录组专题

  1. 欢迎进入空间转录组学时代！

  2. 空间转录组测序时代到来-高分文章新热点

  3. 两个“年度技术”碰撞，带来cell火花四溅

  4. 空间转录组+scRNA-seq，带您玩转空间细胞图谱的套路

  5. 空间转录组学为渐冻症的治疗带来新希望~

  6. 新冠？流感？单细胞+空间转录组带您了解病毒如何损伤肺功能

  7. 10X Genomics的空间转录组技术全攻略之样本准备篇（超详细）

  8. 10X Genomics的空间转录组技术全攻略之组织透化优化实验（Tissue Optimization）

  9. 10X Genomics的空间转录组技术全攻略之空间基因表达实验

  10. 千呼万唤，10XGenomics 的FFPE样本Spatial Visium 基因表达方案来了！

  11. 空间转录组后续实验验证方法，总有一款适合您~

  12. 10X Genomics的空间转录组技术，到底有多少？

  13. FFPE样本如何实现空间转录组研究？

  14. 国内首篇！10x Genomics单细胞+Visium空间转录组


03

单细胞V(D)J专题

  1. 单细胞转录组+单细胞免疫组库全面揭示COVID-19免疫特征




03
作图技巧


  1. 画泡泡图，发CNS

  2. 我画的图只能发Plos One？Genome Research的图长啥样？

  3. Cell的模式图画反，反，反了

  4. 我把Nature的Figure画成了蒙娜丽莎

  5. 用同样的工具画图，卖家秀Nature communications VS. 买家秀Nature Genetics

  6. 拜这个图， 答辩必过！

  7. Y叔又炫技了！有啥用？还真能发CNS！

  8. 不要截屏，我要矢量图！

  9. 我要用1h完成所有发表级Figure的排版 | 悬赏100元，招募latex高手

  10. 72h，小白也能画出CNS图

  11. 打开R脚本，汉字乱码，怎么破？

  12. 用1h完成Figure排版，illustrator学会这点技能就够了

  13. 从未见过这么美的GSEA结果图

  14. 从未见过这么美的染色体分布图！直的、美的、不限物种的

  15. 我有这么多GSEA矢量图代码，喜欢哪个就画哪个

  16. 我终于迈出了自学生信的第一步

  17. 牛人的智慧超出了我的想象，GSEA居然可以这样用

  18. 多么希望作者们联手开发个“真正好用”的包啊！

  19. 他把棒棒糖画到了极至，还跟【神图】画在了一起

  20. 点点鼠标就能给12分paper加2个图，今年已经用在206篇paper里，你还不知道？

  21. SNP影响了“转录因子”结合，这个图你一定需要

  22. 非编码区的SNP影响转录因子结合，进而影响表型之HaploReg

  23. 非编码区的SNP影响转录因子结合，进而影响表型之RegulomeDB

  24. 最美最灵活的热图、瀑布图，不用代码，点鼠标全实现

  25. Pvalue<0.001，可是肉眼看不出来差异，怎么办？断开Y轴

  26. 又有小伙伴的paper>27. 基因在哪个组织里高表达，美图要这样用到paper里

  27. 基因在哪个组织里高表达？R画给你看

  28. 基因/蛋白在哪个组织高/低表达？这个图一目了然

  29. Cell paper最近喜欢画这个图，终于能套进我的paper里了

  30. 这篇Cell paper霸气了，全是批量出图

  31. 没有统计检验，再美也不算好图

  32. 只画两个火山图，居然能挖出这么深层的规律

  33. 灌水才把“火山图”放正文里？只能说你不懂得它的妙用

  34. 你做了ChIP-seq，却挖不出机制？因为没画这个图

  35. GSEA人人都会，唯有你能画出这样的美图

  36. 不懂生信，不装Linux，也能Run代码—Windows系统的Linux命令行工具Babun

  37. 生信入门路 | 生物/医学人的生信启蒙

  38. 2017年生信学习终极豪华套餐

  39. 14位生信前辈给的生信入门建议——消除进阶Level 1的困惑

  40. 7位生信前辈的感悟～高阶Level 1、Level 2、Level3！

  41. 我好像进了个假的Top 1大牛组

  42. 新学期，老板将对我刮目相看！

  43. 四海八荒都在这篇Cell paper里，按这套代码画完图，你便上知天文下知地理

  44. 没做实验，就攒齐了一篇5分paper所有的Figure

  45. 分享免费版，小丫画图生意不做了？

  46. TMB怎么用？到上个月的图里找

  47. Cell paper就是要让你完全重复出来，代码、原始数据、中间结果，还有超贴心的说明文档

  48. 科研工匠的众筹模式——小丫画图群公告

  49. 这个神了，不只有代码，还有输入数据，每个图一个文件夹

  50. TCGA | 基因表达跟CNV的关系，Cell paper又给代码了，你却没看到

  51. TMB还能做分子时钟，Cell paper又给代码了

  52. 随时随地看代码，你的手机只差这一个app超级酷炫的“山鸡”图，要这样用到paper里

  53. 只有两例免疫治疗患者，这样发12分 | 不做细胞系/模式生物/敲除/过表达

  54. 曾经有发表10+分的机会摆在我面前，我没有去珍惜。。

  55. 别人顺利画出了美图，为啥我总是遇到问题？

  56. 就用这套代码，完全复现这篇Nature Communications

  57. 画最美染色体，就要用这个新工具 | 今天被CRAN接收

  58. 这一年，我们投了十几篇paper

  59. GO富集出来的第123条pathway本质上都是同一条，怎么办？这个函数支持差异基因富集分析，也支持GSEA

  60. 神秘的pan-cancer图，终于能用到我的paper里啦！

  61. 生信大咖给的生信学习建议 | IBW2017答疑Q & A

  62. DNase-seq、ATAC-seq有何异同？跟转录因子有啥关系？一图胜千言

  63. 去TCGA看表型，来CistromeCancer挖机制 | RNA-seq和ChIP-seq的完美结合

  64. 原来他们在这儿偷偷练了一年R画图

  65. 娱乐圈没事儿读个博士，科研圈的博士们闲起来居然干这事儿

  66. 怎么随心所欲画Track图，看完这个就会了



04
表观杂谈


  1. 大师姐答疑 | CRISPR screen | 自己也能做CRISPR高通量筛选
  2. 课题方向选择、基金申请、艺术交流 —— 且听IBW2017大会报告人讲述自己的亲历经验
  3. Genome Biology第一作者访谈 | 怎样问生物学问题？做开创性研究的过程中遇到哪些瓶颈？怎样解决？
  4. 科学，技术是第一生产力 | 细胞生物学2017年会感受
  5. 表观遗传小白逆袭之道：从这 19 个视频开始吧！
  6. 摘要写成啥样，被引次数多？| 嘉因生物发表文章的影响力超过70%的研究论文
  7. 秋天来了，苹果熟了 | fruitENCODE、C3C4数据查询
  8. Minutes and impressions of the IBW 2017
  9. 【答疑】eCLIP-seq的重复次数和对照
  10. 装这个app，妈妈再不骂我捧着手机不干正事了 | 北大唐泽方讲GE-mini和GEPIA的视频
  11. 果蝇里发现的机制，用人和小鼠验证失败怎么办？看拟南芥的！
  12. 等我有钱了，测他一亿人的基因组
  13. 旧文带来新启示，内行看门道，10分等你来发
  14. TCGA，她已经用了七年 | 资深用户深度点评
  15. 国自然有这个图，谁敢说缺创新点
  16. 把Cell爆文的思路、方法用到自己的研究中
  17. 14万人的表达谱等你点鼠标
  18. 等我有钱了，我也这样研究一个基因
  19. 再次把Cell爆文的思路、方法用到自己的课题上
  20. 不写代码了，改手绘
  21. 相同的实验，不同的作者，不同的表现形式，结论一致吗？
  22. 一个出身寒门的副教授之转行
  23. 那么多出身寒门的副教授都没转行
  24. 我们计划招收300名学员，免费攻读人工智能专业
  25. ENCODE IDR pipeline Q&A 视频记录

  26. 富集分析，十年的思考

  27. 超详细的GEO数据上传攻略，一看就会

  28. 知识分子的理想副业，带你入门

  29. 原来RNA最怕忽冷忽热

  30. 这么多讲座，随便pick一个，你都能成为专家

  31. 包教包会，表观必备技能cistrome

  32. 包教包会，表观必备技能UCSC查找心仪基因转录因子

  33. 包教包会，表观小技能之抗体查找

  34. 包教包会，表观必备技能JASPAR

  35. 包教包会，表观必备技能WashU Epigenome Browser

  36. 包教包会，表观必备技能之Genecards查看基因信息

  37. 包教包会，表观必备技能之HOCOMOCO

  38. 包教包会，表观必备技能之MEME-ChIP

  39. 借用别人的已发表测序数据，让自己的研究结果更丰满

  40. 首个这种类型的单细胞数据库，你值得拥有

  41. 这个神奇的Aging数据库，都快集齐多组学的七龙珠了！

  42. 玩转表观，有它就足够

  43. 超详细的SRA数据上传攻略，一看就会




05
嘉因成长经历


  1. 嘉因生物获千万人民币Pre-A轮融资，加速科研服务向临床产品开发的转化

  2. 嘉因生物荣获2015年最佳创新创意创业奖

  3. 嘉因生物获得2016年博士后创新实践基地企业认定和资助，最高额哦！！！

  4. 嘉因生物拟认定为2016上海市高新技术企业

  5. 嘉因生物获第二届杨浦创业之星大赛创业新苗奖！！

  6. 别人都在剁手的时候，科研销售在做什么？

  7. 嘉因生物携手多伦多大学何厚胜课题组，联合推出微量RNA全转录组m6A图谱分析（MeRIP-seq）

  8. 震撼来袭|嘉因生物单细胞ATAC-seq测试数据已下机

  9. 嘉因生物单细胞ATAC-seq通过10x Genomics CSP认证，成为全国首个官方认证服务商

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