遗传解读丨选择先证者全外还是Trio家系全外?
发布于 2021-10-12 11:27
前言
随时间的发展,高通量测序技术逐步应用在医学领域,从基因的角度给医生提供疾病诊断的依据。临床上应用最多的当属“全外显子”,而全外又被细分为先证者全外和Trio家系全外,您是否曾有过疑问,家中孩子患病只要查他的发病原因就行,为何医生会建议父母同时检测全部数据;低价格能解决的为何要花近两倍的价格,两者的区别究竟在哪?今天就让小编为你解开这些疑惑。
1、全外显子项目介绍
全外显子检测项目涵盖了所有的功能基因,包括已知的致病基因和未知的基因,检测基因数量约20000个,针对的是多症状、临床方向不明、诊断困难且怀疑遗传因素的患者。项目是利用靶向捕获技术对全基因组外显子区域以及外显子上下游10bp的内含子碱基或更深层次的内含子进行捕获、测序和分析,可以一次性对人类基因组中的全部外显子进行测序分析,目的在于找出可能影响蛋白结构的变异,以期为患者确诊,指导治疗及预后。
2、先证者全外VS Trio家系全外
先证者全外是对先证者进行全外显子组检测及线粒体组3000X检测;Trio家系全外是对指定三人进行全外显子组检测及线粒体3000X检测,多了两位家系成员全外检测数据。
两个项目对于疑似致病位点,均可在出具报告后一个月之内对直系家属免费进行一代测序验证;出具先证者报告一份。
每个检测者检测后得到的下机数据,经过生物信息分析注释有数万条之多,在茫茫数据中找寻可能致病的变异位点,犹如大海捞针,如何将大量无意义,疑似为良性的位点过滤掉成为一个重要的环节。首先会对数据进行注释及过滤,过滤是通过变异位置、变异类型、变异频率、变异位点在数据库中的特征等对注释结果进行过滤,保留可能的疾病有关的变异。
先证者全外仅有本人数据,会在过滤后的数据中,结合提供的临床信息来找寻可能致病的变异,对于疑似致病位点进行一代验证,同时进行家系来源分析,在拿到父母的检测结果后,才可结合家族史、父母的携带情况、遗传方式等综合判断位点的致病性。
Trio家系全外有家系成员的检测数据,每个位点的携带情况均可做到可视化,位点是新生变异还是遗传自父母一目了然;对于有家族史的家系来说,可重点分析两位患者同时携带的变异,基因定位更精准;对父母无症状的家系,那么新生变异的情况致病性比较强,结合父母数据分析,可直接识别出新生变异;对于一些AR遗传的疾病,可根据父母位点的携带情况,判断是否满足遗传方式,优先选择符合家系共分离的变异,避免走弯路。
总结
通过小编的介绍,是否让您对于先证者全外和Trio全外有个大概的了解了呢,希望此篇文章可以给您带来帮助。
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