生物信息学知多少 Part11

发布于 2022-06-03 08:56


零代码实操生信文章-11

生物信息学相关的文章,因为其不需要实验或者仅需要少量实验验证,深受广大毕业硕博们以及急需文章的医师们喜爱。我之前用5期来为大家讲解了如何零代码实操一篇生信文章,接着又用了3期讲解如何花式去找差异基因。上一期我们进入新的模块,如何花式构建网络图(一):如何构建miRNAs-hubgenes网络图。

这一期我们接着来介绍一个数据库来构建miRNAs-hubgenes网络图。这样最后得到与基因相关的预测miRNAs就可以使用韦恩图去取交集,假阳性概率就会小很多,最后validation部分出现阳性结果的可能性就会更大一些。

miRecords主页及Validatedtargets检索




miRecords的Predictedtargets检索




不同miRNA-靶基因预测网站




之后,就可以去构建miRNAs-hubgenes网络图了。如何去构建网络图,可以参考第4期的Cytoscape软件使用部分。这么好的数据库还不赶紧实操起来。下一期,我们介绍新的东西,如何构建转录因子-靶基因网络图。


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